Cómo hacer el alineamiento múltiple con clustal:
     1.-clustalw
     2.-selecciona la opción 1 "Sequence Input From Disc" e introduce el nombre del fichero FASTA que tiene las secuencias.
     3.-selecciona la opción 2 "multiple alignments".
     4.-selecciona la opción 9 "Output format options". Ahora selecciona la opción 3 "Toggle GCG/MSF format output" para que guarde el
     alineamiento como "MSF".
     5.-dale a "enter".
     6.-selecciona la opción 1 "Do complete multiple alignment now (Slow/Accurate)" y asigna el nombre que desees a los ficheros de
     salida (los que generará clustal).
     7.- esperar a que termine

Cómo ver el alineamiento múltiple: por ejemplo con el programa belvu, poniendo en la línea de comandos "belvu [fichero].msf".