Cómo hacer el alineamiento múltiple con clustal:
1.-clustalw
2.-selecciona la opción 1 "Sequence
Input From Disc" e introduce el nombre del fichero FASTA que tiene las
secuencias.
3.-selecciona la opción 2 "multiple
alignments".
4.-selecciona la opción 9 "Output format
options". Ahora selecciona la opción 3 "Toggle GCG/MSF format output"
para que guarde el
alineamiento como "MSF".
5.-dale a "enter".
6.-selecciona la opción 1 "Do complete
multiple alignment now (Slow/Accurate)" y asigna el nombre que desees a
los ficheros de
salida (los que generará clustal).
7.- esperar a que termine
Cómo ver el alineamiento múltiple: por ejemplo con el
programa belvu, poniendo en la línea de comandos "belvu [fichero].msf".