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EVA summary for category sec (2)

Contents

About secondary structure prediction methods evaluated

Method NprotNweekDetailed results for method
ALL 432 88 method/index.html
APSSP   00method/apssp.html
APSSP2   35073method/apssp2.html
JPred   16729method/jpred.html
JUFO   12735method/jufo.html
PHD   36174method/phd.html
PHDpsi   35874method/phdpsi.html
PROF_king   35981method/prof_king.html
PROFsec   36174method/profsec.html
Prospect   27570method/prospect.html
PSIpred   35881method/psipred.html
PSSP   11method/pssp.html
SABLE   7118method/sable.html
SABLE2   141method/sable2.html
SAM-T99sec   31381method/samt99_sec.html
SCRATCH (SSpro3)   15036method/scratch.html
SSpro1   11method/sspro1.html
SSpro2   25748method/sspro2.html
  31method/sspro4.html
  63method/yaspin.html

 


Comparison of secondary structure prediction methods (detail level 2)

Averages compiled over different subsets

 


Set 1

Sorted alphabetically for identical ranks!     MORE SCORES    
subset nprot sots rank method Q3 ERRsigQ3 sov ERRsigsov BAD ERRsigBAD info ERRsiginfo corrH ERRsigcorrH corrE ERRsigcorrE corrL ERRsigcorrL class ERRsigclass
common 11dssp1JPred84.5+/-10.079.1+/-10.00.0+/-10.00.38+/-10.001.00+/-10.000.69+/-10.000.69+/-10.00100.0+/-10.0
PHD75.5+/-10.074.0+/-10.00.9+/-10.00.34+/-10.001.00+/-10.000.68+/-10.000.58+/-10.00100.0+/-10.0
PHDpsi82.7+/-10.084.1+/-10.00.0+/-10.00.40+/-10.001.00+/-10.000.69+/-10.000.69+/-10.000.0+/-10.0
PROF_king80.9+/-10.087.0+/-10.00.0+/-10.00.40+/-10.001.00+/-10.000.67+/-10.000.67+/-10.000.0+/-10.0
PROFsec80.9+/-10.088.3+/-10.00.0+/-10.00.40+/-10.001.00+/-10.000.67+/-10.000.67+/-10.000.0+/-10.0
Prospect70.9+/-10.063.7+/-10.00.0+/-10.00.22+/-10.001.00+/-10.000.53+/-10.000.49+/-10.000.0+/-10.0
PSIpred70.9+/-10.063.7+/-10.00.0+/-10.00.22+/-10.001.00+/-10.000.53+/-10.000.49+/-10.000.0+/-10.0
SAM-T99sec78.2+/-10.074.7+/-10.00.0+/-10.00.25+/-10.001.00+/-10.000.57+/-10.000.57+/-10.000.0+/-10.0
SSpro279.1+/-10.086.8+/-10.00.0+/-10.00.34+/-10.001.00+/-10.000.63+/-10.000.63+/-10.000.0+/-10.0
common 11dssp2APSSP256.4+/-10.045.9+/-10.04.5+/-10.00.10+/-10.001.00+/-10.000.40+/-10.000.22+/-10.00100.0+/-10.0

 


Set 2

Sorted alphabetically for identical ranks!     MORE SCORES    
subset nprot sots rank method Q3 ERRsigQ3 sov ERRsigsov BAD ERRsigBAD info ERRsiginfo corrH ERRsigcorrH corrE ERRsigcorrE corrL ERRsigcorrL class ERRsigclass
common 21dssp1JPred84.5+/-10.079.1+/-10.00.0+/-10.00.38+/-10.001.00+/-10.000.69+/-10.000.69+/-10.00100.0+/-10.0
PHD75.5+/-10.074.0+/-10.00.9+/-10.00.34+/-10.001.00+/-10.000.68+/-10.000.58+/-10.00100.0+/-10.0
PHDpsi82.7+/-10.084.1+/-10.00.0+/-10.00.40+/-10.001.00+/-10.000.69+/-10.000.69+/-10.000.0+/-10.0
PROF_king80.9+/-10.087.0+/-10.00.0+/-10.00.40+/-10.001.00+/-10.000.67+/-10.000.67+/-10.000.0+/-10.0
PROFsec80.9+/-10.088.3+/-10.00.0+/-10.00.40+/-10.001.00+/-10.000.67+/-10.000.67+/-10.000.0+/-10.0
PSIpred70.9+/-10.063.7+/-10.00.0+/-10.00.22+/-10.001.00+/-10.000.53+/-10.000.49+/-10.000.0+/-10.0
SAM-T99sec78.2+/-10.074.7+/-10.00.0+/-10.00.25+/-10.001.00+/-10.000.57+/-10.000.57+/-10.000.0+/-10.0
SSpro279.1+/-10.086.8+/-10.00.0+/-10.00.34+/-10.001.00+/-10.000.63+/-10.000.63+/-10.000.0+/-10.0

 


Set 3

Sorted alphabetically for identical ranks!     MORE SCORES    
subset nprot sots rank method Q3 ERRsigQ3 sov ERRsigsov BAD ERRsigBAD info ERRsiginfo corrH ERRsigcorrH corrE ERRsigcorrE corrL ERRsigcorrL class ERRsigclass
common 31dssp1JPred84.5+/-10.079.1+/-10.00.0+/-10.00.38+/-10.001.00+/-10.000.69+/-10.000.69+/-10.00100.0+/-10.0
PHD75.5+/-10.074.0+/-10.00.9+/-10.00.34+/-10.001.00+/-10.000.68+/-10.000.58+/-10.00100.0+/-10.0
PHDpsi82.7+/-10.084.1+/-10.00.0+/-10.00.40+/-10.001.00+/-10.000.69+/-10.000.69+/-10.000.0+/-10.0
PROF_king80.9+/-10.087.0+/-10.00.0+/-10.00.40+/-10.001.00+/-10.000.67+/-10.000.67+/-10.000.0+/-10.0
PROFsec80.9+/-10.088.3+/-10.00.0+/-10.00.40+/-10.001.00+/-10.000.67+/-10.000.67+/-10.000.0+/-10.0
PSIpred70.9+/-10.063.7+/-10.00.0+/-10.00.22+/-10.001.00+/-10.000.53+/-10.000.49+/-10.000.0+/-10.0
SAM-T99sec78.2+/-10.074.7+/-10.00.0+/-10.00.25+/-10.001.00+/-10.000.57+/-10.000.57+/-10.000.0+/-10.0

 


Set 4

Sorted alphabetically for identical ranks!     MORE SCORES    
subset nprot sots rank method Q3 ERRsigQ3 sov ERRsigsov BAD ERRsigBAD info ERRsiginfo corrH ERRsigcorrH corrE ERRsigcorrE corrL ERRsigcorrL class ERRsigclass
common 41dssp1JPred84.5+/-10.079.1+/-10.00.0+/-10.00.38+/-10.001.00+/-10.000.69+/-10.000.69+/-10.00100.0+/-10.0
PHD75.5+/-10.074.0+/-10.00.9+/-10.00.34+/-10.001.00+/-10.000.68+/-10.000.58+/-10.00100.0+/-10.0
PHDpsi82.7+/-10.084.1+/-10.00.0+/-10.00.40+/-10.001.00+/-10.000.69+/-10.000.69+/-10.000.0+/-10.0
PROFsec80.9+/-10.088.3+/-10.00.0+/-10.00.40+/-10.001.00+/-10.000.67+/-10.000.67+/-10.000.0+/-10.0
PSIpred70.9+/-10.063.7+/-10.00.0+/-10.00.22+/-10.001.00+/-10.000.53+/-10.000.49+/-10.000.0+/-10.0
SAM-T99sec78.2+/-10.074.7+/-10.00.0+/-10.00.25+/-10.001.00+/-10.000.57+/-10.000.57+/-10.000.0+/-10.0

 


Set 5

Sorted alphabetically for identical ranks!     MORE SCORES    
subset nprot sots rank method Q3 ERRsigQ3 sov ERRsigsov BAD ERRsigBAD info ERRsiginfo corrH ERRsigcorrH corrE ERRsigcorrE corrL ERRsigcorrL class ERRsigclass
common 558dssp1PSIpred77.1+/-1.475.4+/-2.12.9+/-0.80.35+/-0.030.68+/-0.030.71+/-0.040.55+/-0.0384.5+/-4.8
SAM-T99sec77.1+/-1.274.0+/-1.74.0+/-0.90.38+/-0.020.66+/-0.030.71+/-0.040.58+/-0.0287.9+/-4.3
common 558dssp2PROFsec75.4+/-1.575.0+/-2.04.6+/-0.90.36+/-0.020.67+/-0.030.71+/-0.040.56+/-0.0382.8+/-5.0
common 558dssp3PHD72.5+/-1.569.1+/-2.16.4+/-1.40.33+/-0.020.62+/-0.040.68+/-0.040.52+/-0.0384.5+/-4.8
PHDpsi72.9+/-1.569.3+/-2.26.2+/-1.40.34+/-0.020.63+/-0.040.68+/-0.040.53+/-0.0384.5+/-4.8

 


Set 6

Sorted alphabetically for identical ranks!     MORE SCORES    
subset nprot sots rank method Q3 ERRsigQ3 sov ERRsigsov BAD ERRsigBAD info ERRsiginfo corrH ERRsigcorrH corrE ERRsigcorrE corrL ERRsigcorrL class ERRsigclass
common 659dssp1PSIpred77.1+/-1.475.7+/-2.12.8+/-0.80.35+/-0.020.68+/-0.030.71+/-0.040.55+/-0.0284.7+/-4.7
common 659dssp2PROFsec75.4+/-1.575.1+/-2.04.5+/-0.90.36+/-0.020.67+/-0.030.71+/-0.040.56+/-0.0283.1+/-4.9
common 659dssp3PHD72.7+/-1.569.4+/-2.16.3+/-1.40.33+/-0.020.63+/-0.040.68+/-0.040.53+/-0.0383.1+/-4.9
PHDpsi73.1+/-1.569.7+/-2.16.1+/-1.40.34+/-0.020.63+/-0.040.68+/-0.040.53+/-0.0383.1+/-4.9

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