EVA results for 1lj2:B

DATE : 2002_07_10
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....1
seq	MHSLQNVIPQQQAHIAELQVYNNKLERDLQNKIGSLTSSIEWYLRSMELDPEIKADIEQQINSIDAINPLHAFDDLESVIRNLISDYDKLFLMFKGLIQRSNYQYSFGSE
dssp	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEEE-
apssp	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHH------HHHHHHHHHH----HHHH-HHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EE-----	+6.5	+19.8	+0.20
apssp2	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEE---	+17.1	-5.2	+0.24
phd	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEE----	+13.7	+25.0	+0.07
phdpsi	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEE----	+11.0	+22.7	+0.03
prof_king	----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHH---EEE----	+14.9	+7.8	+0.21
profsec	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEEE---	+17.4	+25.9	+0.25
prospect	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHH--EEEEE---	+17.2	+3.2	+0.27
psipred	--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEE---	+16.9	+26.6	+0.25
samt99_sec	HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EEEE---	+12.6	+10.4	+0.20
sspro2	---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-H-H--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEE----	+20.1	+17.7	+0.37

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Jul 23, 2003
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva