EVA results for 1n1c:A

DATE : 2003_05_13
TYPE : sec
NRES : 199
HEADER : CHAPERONE
COMPND : 2 MOLECULE: TORA SPECIFIC CHAPERONE;
SOURCE : 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: SHEWANELLA MASSILIA;
AUTHOR : S.TRANIER, C.IOBBI-NIVOL, I.MORTIER-BARRIERE, C.BIRCK, V.MEJEAN,

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10.
seq	VDINPARALVYQLLSSLFAREVDEQRLKELTSEAAQQFWEQLSLEANFTQSVDKIRSTLNGIKDDEALLELAADYCGLFLVGTSASPYASLYLLLFGEQHQQ
dssp	---HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHH-HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH--------EHHHH----HHHHHH
jufo	----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-EEEEE------EEEEEEEE---HHH	+2.3	-2.7	-0.04
phd	----HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-EEEEEEEEE	+11.5	+12.3	-0.00
phdpsi	----HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHH------------------HHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-EEEEEEEEE	+9.5	+10.6	-0.02
prof_king	----HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH--EEEE-------EEEE------HHHHHHHHHHH-HHHHH--------HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EEEEEE	+0.7	+12.5	-0.14
profsec	----HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH---------EEE-------HHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEH	+7.9	+12.7	0.00
samt99_sec	HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHEE----------EE-HHH-HHHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------EE	+6.2	+9.2	-0.13
scratch	----HHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH--EE--------HHHE------HHHHHHHHHHH----E-------HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HEEEEE-	+8.5	+3.8	+0.01

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: May 21, 2003
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva