Home - sec - acc - cm - fr - con - Bottom

EVA results for 1f3v:A

DATE : 2000_09_06
TYPE : sec
NRES : 158
HEADER : APOPTOSIS
COMPND : MOL_ID: 1;
SOURCE : MOL_ID: 1;
AUTHOR : Y.C.PARK, H.YE, C.HSIA, D.SEGAL, R.RICH, H.-C.LIOU, D.MYSZKA, H.WU

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,...
seq	HEEWVGSAYLFVESSLDKVVLSDAYAHPQQKVAVYRALQAALAESGGSPDVLQMLKIHRSDPQLIVQLRFCGRQPCGRFLRAYREGALRAALQRSLAAALAQHSVPLQLELRAGAERLDALLADEERCLSCILAQQPDRLRDEELAELEDALRNLKCG
dssp	----EEEEEEEEEE------HHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHH------EEEEEEEE----EEEEEEEE-HHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHH-------EEEEEEE--EEHHHH---HHHHHHHHHH----E---HHHHHHHHHHHHH---
eva3	------EEEEEE----HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHH----HHHHEEEEEE----EEEEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH----	-3.9	-1.2	-0.03
eva4	------EEEEEEE----HHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHH-----EEEEEE------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH----	-9.9	-9.0	-0.11
jpred	------EEEEEE-----HHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHH-----HHHHEE--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH----	-7.8	-4.3	-0.10
phd	---EEEEEEHHHHHHHHHHEHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH---	-14.2	-15.3	-0.1
phdpsi	---EEEEEEEHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHH------EEEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHH-HHHHHHHHHHHHHH---	-9.4	-15.7	-0.05
prof	----EEEEEEEE-----HHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHH-----EEEEEEE-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH----	-5.3	-4.2	-0.04
psipred	------EEEEEE----HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH------EEEEEEEE----EEEEEEEE-----HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHH-----EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHH-----	+0.7	+9.9	+0.02
pssp	---EE--EEEEE-----EEEEE-------HHHHHHHHHHHHHH------HHHHHH-------EEEEE----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH---	-3.4	-3.9	-0.06
sspro	-------EEEEEE----HEEE-H-H--HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHH-----EEEEEE-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHH----	-10.9	-7.9	-0.17

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : abbreviation of prediction method (seq=sequence)
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

All results

Last update: Dec 29, 2000
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva
WWW mirrors: ../../../doc/mirrors.html

Home - sec - acc - cm - fr - con - Top