Xylella fastidiosa

HIGH-QUALITY AUTOMATED AND MANUAL ANNOTATION OF MICROBIAL PROTEOMES

HAMAP
home

HAMAP
proteomes

HAMAP
families

HAMAP
documents

HAMAP
FTP server

Species: Xylella fastidiosa

Species code: XYLFA

Type: Eubacteria

Taxonomy: Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Xylella (TaxID: 2371) [NEWT / NCBI]

Strain(s): 9a5c

Genome: circular, 2.68 Mb; 2 plasmids of 51 Kb and 1.2 Kb

Reference(s): MEDLINE=20365717 [NCBI, ExPASy, Israel, Japan]; PubMed=10910347;
Simpson A.J.G., Reinach F.C., Arruda P., Abreu F.A., Acencio M., Alvarenga R., Alves L.M.C., Araya J.E., Baia G.S., Baptista C.S., Barros M.H., Bonaccorsi E.D., Bordin S., Bove J.M., Briones M.R.S., Bueno M.R.P., Camargo A.A., Camargo L.E.A., Carraro D.M., Carrer H., Colauto N.B., Colombo C., Costa F.F., Costa M.C.R., Costa-Neto C.M., Coutinho L.L., Cristofani M., Dias-Neto E., Docena C., El-Dorry H., Facincani A.P., Ferreira A.J.S., Ferreira V.C.A., Ferro J.A., Fraga J.S., Franca S.C., Franco M.C., Frohme M., Furlan L.R., Garnier M., Goldman G.H., Goldman M.H.S., Gomes S.L., Gruber A., Ho P.L., Hoheisel J.D., Junqueira M.L., Kemper E.L., Kitajima J.P., Krieger J.E., Kuramae E.E., Laigret F., Lambais M.R., Leite L.C.C., Lemos E.G.M., Lemos M.V.F., Lopes S.A., Lopes C.R., Machado J.A., Machado M.A., Madeira A.M.B.N., Madeira H.M.F., Marino C.L., Marques M.V., Martins E.A.L., Martins E.M.F., Matsukuma A.Y., Menck C.F.M., Miracca E.C., Miyaki C.Y., Monteiro-Vitorello C.B., Moon D.H., Nagai M.A., Nascimento A.L.T.O., Netto L.E.S., Nhani A. Jr., Nobrega F.G., Nunes L.R., Oliveira M.A., de Oliveira M.C., de Oliveira R.C., Palmieri D.A., Paris A., Peixoto B.R., Pereira G.A.G., Pereira H.A. Jr., Pesquero J.B., Quaggio R.B., Roberto P.G., Rodrigues V., de Rosa A.J.M., de Rosa V.E. Jr., de Sa R.G., Santelli R.V., Sawasaki H.E., da Silva A.C.R., da Silva A.M., da Silva F.R., Silva W.A. Jr., da Silveira J.F., Silvestri M.L.Z., Siqueira W.J., de Souza A.A., de Souza A.P., Terenzi M.F., Truffi D., Tsai S.M., Tsuhako M.H., Vallada H., Van Sluys M.A., Verjovski-Almeida S., Vettore A.L., Zago M.A., Zatz M., Meidanis J., Setubal J.C.;
"The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa.";
Nature 406:151-159(2000).

Genome official sequence WWW site(s): http://aeg.lbi.ic.unicamp.br/xf/

Other WWW site(s): Proteome site
DOE genome site
Purcell's WWW site
GIB (DDBJ)
TIGR CMR
EBI GeneQuiz

Description: Fastidious, xylem-limited bacterium, which causes a range of economically important plant diseases such as Citrus Variegated Chlorosis (CVC), a serious disease of orange trees and Pierce's disease, a lethal disease of grapevine (currently only known in the Americas).

Properties: Number of membranes : 2
Presence of a flagella : No
Number of inteins : 0

Genomic Proximity Viewer
Proteome analysis at EBI
Perform a BLAST search against all proteins from Xylella fastidiosa
Download ftp file containing all Swiss-Prot and TrEMBL entries of this organism
- in Swiss-Prot format
- in FASTA format

Last modified 12-Apr-2003

ExPASy Home page

Site Map

Search ExPASy

Contact us

Swiss-Prot

HAMAP

Mirror sites:

Species:	Xylella fastidiosa
Species code:	XYLFA
Type:	Eubacteria
Taxonomy:	Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Xanthomonadales; Xanthomonadaceae; Xylella (TaxID: 2371) [NEWT / NCBI]
Strain(s):	9a5c
Genome:	circular, 2.68 Mb; 2 plasmids of 51 Kb and 1.2 Kb
Reference(s):	MEDLINE=20365717 [NCBI, ExPASy, Israel, Japan]; PubMed=10910347; Simpson A.J.G., Reinach F.C., Arruda P., Abreu F.A., Acencio M., Alvarenga R., Alves L.M.C., Araya J.E., Baia G.S., Baptista C.S., Barros M.H., Bonaccorsi E.D., Bordin S., Bove J.M., Briones M.R.S., Bueno M.R.P., Camargo A.A., Camargo L.E.A., Carraro D.M., Carrer H., Colauto N.B., Colombo C., Costa F.F., Costa M.C.R., Costa-Neto C.M., Coutinho L.L., Cristofani M., Dias-Neto E., Docena C., El-Dorry H., Facincani A.P., Ferreira A.J.S., Ferreira V.C.A., Ferro J.A., Fraga J.S., Franca S.C., Franco M.C., Frohme M., Furlan L.R., Garnier M., Goldman G.H., Goldman M.H.S., Gomes S.L., Gruber A., Ho P.L., Hoheisel J.D., Junqueira M.L., Kemper E.L., Kitajima J.P., Krieger J.E., Kuramae E.E., Laigret F., Lambais M.R., Leite L.C.C., Lemos E.G.M., Lemos M.V.F., Lopes S.A., Lopes C.R., Machado J.A., Machado M.A., Madeira A.M.B.N., Madeira H.M.F., Marino C.L., Marques M.V., Martins E.A.L., Martins E.M.F., Matsukuma A.Y., Menck C.F.M., Miracca E.C., Miyaki C.Y., Monteiro-Vitorello C.B., Moon D.H., Nagai M.A., Nascimento A.L.T.O., Netto L.E.S., Nhani A. Jr., Nobrega F.G., Nunes L.R., Oliveira M.A., de Oliveira M.C., de Oliveira R.C., Palmieri D.A., Paris A., Peixoto B.R., Pereira G.A.G., Pereira H.A. Jr., Pesquero J.B., Quaggio R.B., Roberto P.G., Rodrigues V., de Rosa A.J.M., de Rosa V.E. Jr., de Sa R.G., Santelli R.V., Sawasaki H.E., da Silva A.C.R., da Silva A.M., da Silva F.R., Silva W.A. Jr., da Silveira J.F., Silvestri M.L.Z., Siqueira W.J., de Souza A.A., de Souza A.P., Terenzi M.F., Truffi D., Tsai S.M., Tsuhako M.H., Vallada H., Van Sluys M.A., Verjovski-Almeida S., Vettore A.L., Zago M.A., Zatz M., Meidanis J., Setubal J.C.; "The genome sequence of the plant pathogen Xylella fastidiosa."; Nature 406:151-159(2000).
Genome official sequence WWW site(s):	http://aeg.lbi.ic.unicamp.br/xf/
Other WWW site(s):	Proteome site DOE genome site Purcell's WWW site GIB (DDBJ) TIGR CMR EBI GeneQuiz
Description:	Fastidious, xylem-limited bacterium, which causes a range of economically important plant diseases such as Citrus Variegated Chlorosis (CVC), a serious disease of orange trees and Pierce's disease, a lethal disease of grapevine (currently only known in the Americas).
Properties:	Number of membranes : 2 Presence of a flagella : No Number of inteins : 0